Patricia Flatley Brennan, R.N., Ph.D., dirige la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM, por sus siglas en inglés), que forma parte de los Institutos Nacionales de la Salud (NIH). El arduo trabajo de los expertos de la NLM y sus vastos depósitos de información han sido cruciales en la lucha mundial contra la pandemia de COVID-19. La Dra. Brennan compartió las últimas novedades sobre el trabajo de la NLM para fomentar y acelerar los descubrimientos, conectar a las personas con los ensayos clínicos y mucho más.
¿Cuál es la misión de la NLM?
La NLM es una plataforma para el descubrimiento biomédico. Reunimos literatura médica, bancos de datos genómicos así como a investigadores para servir a la ciencia, los científicos, los profesionales de la salud y el público. Y apoyamos el descubrimiento a nivel mundial. En los últimos 30 años no hay descubrimiento biomédico o avance de salud pública o atención clínica que no se haya beneficiado de alguna manera de nuestros recursos.
La NLM, además de líder en investigación biomédica y en datos de ciencias de la salud, es la biblioteca biomédica más grande del mundo. Realizamos y apoyamos investigaciones en biología computacional y ciencias de la salud computacional. También ofrecemos una de las funciones más importantes de una biblioteca en la sociedad, somos un archivo del conocimiento médico a través de los tiempos. Nuestras colecciones incluyen desde libros y revistas con más de 10 siglos de antigüedad hasta las últimas descripciones genómicas electrónicas del virus causante de esta terrible pandemia.
Pensamos en la NLM como una puerta que usted atraviesa para conectarse con datos, literatura médica, información, experiencia y sofisticados modelos matemáticos o imágenes que describen un problema clínico. Esta intersección de información, personas y tecnología nos permite fomentar y acelerar los descubrimientos. Esto ha sido fundamental en el último año, en el que ayudamos al país y a los NIH a responder con rapidez a la pandemia del coronavirus.
¿Cómo está ayudando la NLM a los NIH y a la comunidad científica a comprender mejor el COVID-19?
El personal de la NLM aporta una experiencia especial que ha ayudado al resto de los NIH a responder a esta pandemia. Nuestros científicos de datos ayudan a los investigadores a crear formas confiables de recopilar y manejar los datos de estudios complejos y del trabajo de secuenciación genética. Mediante nuestra investigación y los bancos de datos, colaboramos con equipos de los NIH, de otras agencias gubernamentales y de la comunidad científica más amplia para asegurar que su perspectiva cuente con toda la información biomédica disponible relacionada con los coronavirus, y esto ha sido muy valioso. Sin embargo, lo que es útil aquí no es sólo nuestra literatura médica o nuestras bases de datos, sino también nuestro personal en Bethesda.
Este es sólo un ejemplo: uno de nuestros investigadores de la NLM está utilizando la visión por computadora y el aprendizaje automático para identificar anomalías pulmonares y distinguir si la neumonía es causada por una bacteria o por un virus, e identificar las características visuales únicas del COVID-19. Para ello, recopilamos un alto número de imágenes de radiografías de una biblioteca de imágenes y estudiamos sus patrones de sombreado claro y oscuro con herramientas computarizadas. Al hacer esto repetidamente, las podemos clasificar en grupos e identificar las radiografías de pulmón que tienen un patrón de sombreado similar, lo que indica inflamación por coronavirus y que tiene un aspecto muy diferente del de la neumonía viral o bacteriana. Este modelo nos ayuda a interpretar las radiografías nuevas y ayuda a los médicos a diagnosticar COVID-19 antes, gracias a nuestra biblioteca de imágenes.
¿Qué es el GenBank de la NLM y qué papel ha desempeñado en la lucha mundial contra la pandemia de COVID-19?
GenBank (en inglés) es el banco de todas las secuencias genómicas disponibles públicamente en Estados Unidos. Ha sido crucial tanto en el proceso de desarrollo de vacunas y tratamientos, como en el seguimiento de las nuevas variantes del virus. En enero de 2020, tan sólo un mes después de que se identificó al primer paciente con COVID-19, ya teníamos la secuencia genómica completa del coronavirus. Esto nos permitió presentarles un genoma de referencia [de cómo es la estructura genética del virus] a los científicos que estaban desarrollando vacunas o tratamientos nuevos.
El año pasado seguimos recogiendo muestras de coronavirus y ya tenemos casi 300.000 secuencias del virus SARS-CoV-2. La base de datos de secuencias del GenBank ayuda a los investigadores y a las autoridades de salud pública a ver si el virus está mutando de maneras que puedan requerir otras clases de tratamiento o de prevención.
Los estudios clínicos ayudan a los investigadores a comprender, tratar y prevenir el COVID-19. ¿Cómo ayuda la NLM a los investigadores, los profesionales de la salud y el público en general a informarse sobre los estudios de COVID-19?
La NLM mantiene una base de datos de estudios clínicos de todo el mundo: ClinicalTrials.gov (en inglés). Las personas interesadas en participar en un estudio clínico pueden visitar la página web para encontrar información sobre más de 5.000 estudios clínicos sobre COVID-19, desde vacunas y tratamientos hasta pruebas. El sitio web ClinicalTrials.gov tiene información de contacto de estudios patrocinados por los NIH y por agencias federales, organizaciones sin fines de lucro y la industria privada. Es un recurso que usted puede usar para informarse sobre la participación en un estudio clínico, y para hacerle preguntas al equipo de investigación si desea saber más, por ejemplo, ¿qué tengo que hacer? ¿Qué pruebas o procedimientos se realizan? ¿Cuánto tiempo dura el estudio? ¿Quién supervisará mi atención médica mientras participe en el estudio? ¿Quién pagará mi participación? ¿Me reembolsarán otros gastos?
¿Cómo ayuda el sitio web MedlinePlus al público a obtener información sobre COVID-19 y otros temas de salud?
Además de revista NIH MedlinePlus, también tenemos el sitio web de MedlinePlus. Este recurso, disponible en inglés y español, ofrece información confiable y bien documentada para pacientes y familias sobre miles de temas de salud, entre ellos, el COVID-19. Recientemente hemos añadido varias páginas nuevas sobre COVID-19, incluyendo un resumen general, pruebas y vacunas. Estas páginas ofrecen información actualizada de los NIH y de otras agencias federales, como los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades.
¿De qué otra forma contribuye la investigación de la NLM a la lucha contra la pandemia de COVID-19?
Como parte del Programa de Investigación Intrainstitucional de los NIH, la NLM lleva a cabo investigación sobre las herramientas que se utilizan para comprender datos, biología computacional, bioinformática e informática biomédica. Las herramientas de la biología computacional nos permiten examinar vastos bancos de datos genómicos y comprender los patrones. Por ejemplo, uno de nuestros investigadores está tratando de comprender cómo cambian los virus con el tiempo y de determinar por qué algunas formas de un virus mutan y se vuelven más peligrosas, mientras que otras mutan y se vuelven menos peligrosas. Si logramos comprender estos mecanismos de cambio, podremos predecir qué virus tienen más y menos probabilidades de ser peligrosos para el público.
La NLM también está colaborando en una iniciativa destinada a relacionar las pruebas de COVID-19 (en inglés) de fabricantes específicos con sus sistemas de códigos nacionales apropiados para su uso en los sistemas de historiales médicos. Este trabajo ha sido fundamental para ofrecer informes diarios sobre la distribución de las pruebas para el COVID-19 que obtuvieron la autorización de emergencia de la FDA.
Premio a la excelencia Morris F. Collen 2018: Patricia Flatley Brennan, RN, PhD, FACMI
En honor a Morris F. Collen, pionero en este campo, este prestigioso premio es el más alto honor en informática concedido por el Colegio Americano de Informática Médica a personas cuyo compromiso y dedicación personal a la informática biomédica ha dejado una huella duradera en los campos de la atención médica y la biomedicina.
La NLM está examinando los datos de facturación hospitalaria por COVID-19. ¿Por qué?
Los hospitales generan muchos datos, a veces en el curso de la atención y a veces después, cuando se cobra una factura. Los llamamos datos de reclamaciones. Tenemos equipos de investigadores que examinan la información de las reclamaciones y los registros hospitalarios debidamente aprobados para detectar patrones o relaciones entre el uso de medicamentos, como los inhibidores de la ECA (para la presión arterial) y los anticoagulantes y antiagregantes plaquetarios (para la enfermedad vascular), y las tasas de hospitalización y muerte de personas con COVID-19. Estos patrones puede servir para guiar a los médicos y enfermeros respecto de cuándo iniciar o suspender determinados tratamientos.
¿Cómo consigue la NLM que los científicos accedan rápidamente a la última literatura biomédica sobre el COVID-19?
PubMed (en inglés), la base de datos de citas de literatura biomédica de la NLM, es la más utilizada en el mundo y ha sido reconocida por mucho tiempo como un recurso crítico para ayudar a investigadores, profesionales de la salud, estudiantes y al público en general a mantenerse al día con los rápidos avances en las ciencias de la vida. PubMed ofrece acceso gratuito a más de 32 millones de citas, incluida la literatura médica relacionada con los coronavirus. También hemos iniciado la primera fase de un proyecto piloto para que los ejemplares anticipados de las investigaciones financiadas por los NIH sobre COVID-19 se puedan buscar en PubMed Central. Estos son manuscritos de investigación que aún no se han publicado formalmente o no se han comentado y perfeccionado siguiendo el proceso de revisión por pares. Si se ponen a disposición del público, pueden desempeñar un papel importante al acelerar la difusión de la investigación más reciente.
Además, nuestros científicos de datos pueden aplicar potentes herramientas informáticas utilizando el procesamiento del lenguaje natural y el aprendizaje automático para básicamente leer estos artículos y encontrar relaciones que un lector humano tal vez no hubiera descubierto. También podemos buscar patrones en la literatura médica. Para ello, nos asociamos con más de 50 editores a fin de que los artículos relacionados con el coronavirus sean abiertos y fáciles de acceder ("legibles por máquina"). Y esto está acelerando los descubrimientos científicos sobre COVID-19. Este enfoque aprovecha la capacidad de la NLM no sólo para organizar la literatura médica, sino también para establecer políticas y asociaciones con el sector privado que faciliten el acceso a ella por el bien de la salud pública y la ciencia.
